郑基深


导师介绍

姓名

郑基深


 

工作单位

中国科学技术大学先进技术研究院/中国科学技术大学生命科学学院

学位/职称

博士/研究员

办公室电话

0551-63600795

Email

jszheng@ustc.edu.cn

教育背景

2002/09 - 2006/07,中国科学技术大学,化学,学士2006/09 - 2012/07,中国科学技术大学,化学生物学,博士

研究方向

主要研究膜蛋白的化学合成与调控。以重大疾病密切相关的膜蛋白及其翻译后修饰为研究对象,发展膜蛋白质化学合成技术,获取一系列具有生物活性的中膜蛋白样品。同时,基于高通量筛选技术进行天然蛋白配体分子的功能进化,发现新的活性分子/药物前体分子,开发靶向膜蛋白的蛋白质探针工具,结合现代生物化学和生物物理技术,阐释跨膜蛋白结构-功能机制,实现膜蛋白功能的精确调控。

任职经历

 2012.7-2014.3 清华大学, 生命科学联合中心,博士后

 2014.3-2016.7 中国科学院,强磁场科学中心,副研究员

 2016.7-至今 中国科学技术大学, 生命科学学院,研究员

获得荣誉、奖项

获2014年“清华大学优秀博士后”,第13届中国-国际多肽会议“多肽青年中和奖”等奖励。

主持、参与项目

1. 国家自然科学基金重大研究计划培育项目,91753120,2018/01-2020/12,主持

2. 国家自然科学基金大科学装置联合基金项目,U1732161,2018/01-2020/12,主持

3. 安徽省杰出青年科学基金,蛋白质化学修饰的化学生物学,2018/07-2021/06,主持

4. 合肥物质科学技术中心方向项目培育基金,2017FXCX002,2018/01-2019/12,主持

5. 国家自然科学基金青年科学基金,21402206,2015/01 - 2017/12,主持

6. 安徽省青年科学基金,1508085QB30,2015/07-2017/06,主持

7. 中国博士后科学基金第六批特别资助,2013T60098,2013/06-2014/02,主持

8. 中国博士后科学基金面上资助,2012M520009,2012/10-2014/02,主持

论文、著作

在J Am Chem Soc、Angew Chem Int Ed 、Nature Commun、Nature Protocols和Acc Chem Res等国际高水平杂志发表第一作者、通讯作者论文30余篇。代表性论文:

1. Zhang, B.; Deng, Q.; Zuo, C.; Yan, B.; Zuo, C.; Cao, X. X.; Zhu, T. F.; Zheng, J. S. *; Liu, L.*, Ligation of Soluble but Unreactive Peptide Segments in the Chemical Synthesis of Haemophilus Influenzae DNA Ligase. Angew. Chem. Int. Ed. 2019, 58, DOI: 10.1002/anie.201905149.

2. Tang, S.; Liang, L. J.; Si, Y. Y.; Gao, S.; Wang, J. X.; Liang, J.; Mei, Z.; Zheng, J. S.*; Liu, L.* Practical Chemical Synthesis of Atypical Ubiquitin Chains by Using an Isopeptide-Linked Ub Isomer. Angew. Chem. Int. Ed. 2017, 56, 13333-13337. 

3. Tang, S.; Zuo, C.; Huang, D. L.; Cai, X. Y.; Zhang, L. H.; Tian, C. L.*; Zheng, J. S.*; Liu, L.* Chemical Synthesis of Membrane Proteins via the Removable Backbone Modification Method. Nat. Protoc. 2017, 12, 2554-2569. 

4. Li, J. B.#; Tang, S.#; Zheng, J. S.*; Tian, C. L.*; Liu, L.* Removable Backbone Modification Method for the Chemical Synthesis of Membrane Proteins. Acc. Chem. Res. 2017, 50, 1143-1153. 

5. Zheng, J. S.#; He, Y.#; Zuo, C.; Cai, X. Y.; Tang, S.; Wang, Z. A.; Zhang, L. H., Tian, C. L.*; Liu, L.* Robust Chemical Synthesis of Membrane Proteins through a General Method of Removable Backbone Modification. J. Am. Chem. Soc. 2016, 138, 3553-3561.

6. Chen, X.#; Tang, S.#; Zheng, J. S.#; Zhao, R.; Wang, Z. P.; Shao, W.; Chang, H. N.; Cheng, J. Y.; Zhao, H.; Liu, L.*; Qi, H.* Chemical Synthesis of a Two-Photon-Activatable Chemokine and Photon-Guided Lymphocyte Migration in vivo. Nat. Commun. 2015, 6, 7220-7228.

7. Zheng, J. S.; Yu, M.; Qi, Y. K.; Tang, S.; Shen, F.; Wang, Z. P.; Xiao, L.; Zhang, L.; Tian, C. L.*; Liu, L.* Expedient Total Synthesis of Small to Medium-Sized Membrane Proteins via Fmoc Chemistry. J. Am. Chem. Soc. 2014, 136, 3695-3704.

8. Zheng, J. S.; Tang, S.; Qi, Y.-K.; Wang, Z.-P.; Liu, L.* Chemical Synthesis of Proteins Using Peptide Hydrazides as Thioester Surrogates. Nat. Protoc.2013, 8, 2483-2495.   

9. Zheng, J. S.; Tang, S.; Huang, Y.-C.; Liu, L.* Development of New Thioester Equivalents for Protein Chemical Synthesis. Acc. Chem. Res.2013, 46, 2475–2484. 

10. Zheng, J. S.; Chang, H.-N.; Wang, F.-L.; Liu, L.* Fmoc Synthesis of Peptide Thioesters without Post-Chain-Assembly Manipulation. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 11080-11083.